Es que la cuenca de Pamplona se encuentra en la zona donde la precipitación desciende a mayor velocidad, habiendo diferencias muy apreciables entre en norte y sur de la Cuenca, en la que cada km en direccion N-S cuenta. Por eso creo que el aeropuerto tiene menos precipitación simplemente por encontrarse más al sur. La existencia de más viento en el aeropuerto puede deberse a que está situado en un lugar muy despejado, mientras que el observatorio de la ciudad está más resguardado, ya que el viento norte se acelera(opinión personal) después de pasar el Carrascal.
Por cierto, cogiendo los datos de Julio y Agosto de Pamplona Aeropuerto para este último periodo la formula de Koppen acerca de la mediterranealidad ( 2T>P) arroja datos ya indiscutibles.