Me imagino que en el caso autonómico, al menos en Cataluña, los avisos los pone el Meteocat y se activan los planes de contingencia de cada comunidad. Por ejemplo hoy se ha activado el plan de emergencia contra inundaciones en Barcelona.... Bueno, ayer. Cada comunidad tendrá sus planes específicos en función del terreno y recursos disponibles. Al menos las emergencias meteorológicas dudo que vayan más allá de cada comunidad. Otra cosa sería un incendio, que puede requerir la colaboración entre comunidades.
Siempre abrá excepciones. Si la situación es grave, como sucedió con las nevadas del Bruc, se hizo salir al ejército.
Respecto a alertas amarillas y rojas, tengo entendido que cada servicio tiene sus alertas específicas. No es lo mismo una alerta naranja en Catalunya, que en otra comunidad. Los límites específicos de cada alerta los pone el Meteocat.