Aquí, las estación oficial es la del aeropuerto de Vitoria-Foronda, situada, como se ve en la foto de abajo, a unos 6 km al NW del centro de la ciudad (entre 1.5 y 3.5 de las afueras). De altitud, está a prácticamente la misma que toda la ciudad (entre 505 y 520 m), excepto el cerro fundacional, que coincide con el actual Casco Viejo, con 540 m en sus partes más elevadas.
Como bien decís, donde más diferencias se observan es en la precipitación, porque tiene un carácter mucho más local que la temperatura. Aparte, de que la temperatura no tendría sentido mediarla dentro de la ciudad por el efecto de isla de calor que crea.
Las diferencias más significativas se observan especialmente en espisodios tormentosos. En las grandes ciudades, seguramente en cada barrio la precipiación sea distinta, por lo que, por ejemplo, decir que "la precipitación ayer en Madrid capital fue..." es una entelequia más que otra cosa.
Saludos